【備忘録】Rパッケージのアップデート

R のパッケージを更新してくれるコマンドがあるとは知らず、あるかもしれないと探してみたら、やはりありましたので、自分のためにメモしておきます。

パッケージの動作がおかしいなぁと思っていたら、実はバグだったということがあり、しかも最新のバージョンでは既にフィックスされていて、自分の環境で使っているパッケージが古いだけだった、ということが無いようにしたいものです。

> update.packages()
 --- このセッションで使うために、CRAN のミラーサイトを選んでください --- 
 警告: package 'bitops' in library '/usr/lib64/R/library' will not be updated 
 警告: package 'boot' in library '/usr/lib64/R/library' will not be updated 
 警告: package 'class' in library '/usr/lib64/R/library' will not be updated 
 警告: package 'cluster' in library '/usr/lib64/R/library' will not be updated 
 警告: package 'foreign' in library '/usr/lib64/R/library' will not be updated 
 警告: package 'KernSmooth' in library '/usr/lib64/R/library' will not be updated 
 警告: package 'lattice' in library '/usr/lib64/R/library' will not be updated 
 警告: package 'MASS' in library '/usr/lib64/R/library' will not be updated 
 警告: package 'Matrix' in library '/usr/lib64/R/library' will not be updated 
 警告: package 'mgcv' in library '/usr/lib64/R/library' will not be updated 
 警告: package 'nlme' in library '/usr/lib64/R/library' will not be updated 
 警告: package 'nnet' in library '/usr/lib64/R/library' will not be updated 
 警告: package 'rpart' in library '/usr/lib64/R/library' will not be updated 
 警告: package 'spatial' in library '/usr/lib64/R/library' will not be updated 
 警告: package 'survival' in library '/usr/lib64/R/library' will not be updated 
 警告: package 'qcc' in library '/usr/share/R/library' will not be updated 
ggplot2 :
 Version 0.9.3.1 installed in /home/bitwalk/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/3.0 
 Version 1.0.0 available at http://cran.ism.ac.jp
Update (y/N/c)?  y
 URL 'http://cran.ism.ac.jp/src/contrib/ggplot2_1.0.0.tar.gz' を試しています 
Content type 'application/x-gzip' length 2351447 bytes (2.2 Mb)
 開かれた URL 
==================================================
downloaded 2.2 Mb

* installing *source* package ‘ggplot2’ ...
**  パッケージ ‘ggplot2’ の解凍および MD5 サムの検証に成功しました 
** R
** data
*** moving datasets to lazyload DB
** inst
** preparing package for lazy loading
** help
*** installing help indices
  converting help for package ‘ggplot2’
    finding HTML links ...  完了 
    absoluteGrob                            html  
    add_theme                               html  
    aes                                     html  
...
（省略）
...
    waiver                                  html  
    xylim                                   html  
    zeroGrob                                html  
** building package indices
** installing vignettes
** testing if installed package can be loaded
* DONE (ggplot2)

 ダウンロードされたパッケージは、以下にあります 
  ‘/tmp/RtmpW7V7cU/downloaded_packages’ 
> 

参考サイト

1. R Installation and Administration - 6.4 Updating packages